Reseña de SpectralBench: lo que hace bien y en qué se queda corto

Qué es SpectralBench

SpectralBench es un entorno de trabajo de espectroscopía. Se abre en un navegador web: basta con arrastrar un archivo de espectro para visualizar, procesar y analizar los datos sin instalar nada. Abarca datos de FTIR, Raman, NIR, UV-Vis, fluorescencia y espectrometría de masas, y combina el entorno de trabajo con una biblioteca de espectros de referencia en la que se pueden hacer búsquedas.

Esta reseña de SpectralBench examina lo que ofrece la plataforma hoy, lo que le falta y a qué laboratorios les conviene. Le damos una calificación de 8.0 sobre 10, la misma que recibe en nuestra clasificación de software FTIR y de espectroscopía gratuito.

Disponibilidad y precio

SpectralBench funciona en un navegador web en spectralbench.com. La biblioteca de espectros de referencia es pública y se puede consultar sin cuenta.

SpectralBench es gratuito. Prevé planes de pago, pero no ha anunciado precios, así que todavía no podemos decir qué funciones seguirán siendo gratuitas. Actualizaremos esta reseña cuando se publiquen los precios.

Formatos de archivo compatibles

La compatibilidad de formatos es el punto más fuerte de SpectralBench. Lee directamente unos 30 formatos y detecta el formato automáticamente al cargar un archivo. La mayoría de las herramientas web gratuitas se limitan a JCAMP-DX y CSV; SpectralBench también abre los archivos binarios propietarios que generan los instrumentos, por lo que no necesita el software del fabricante para exportarlos primero.

Hay dos limitaciones. Los archivos de grupo SPG de Thermo Fisher solo abren su primer espectro. Y, sin cuenta, los archivos están limitados a 4 MB; una cuenta gratuita eleva el límite a 100 MB por archivo. Los mapas Raman grandes y las series temporales largas pueden superar el límite de 4 MB.

Funciones de análisis

Preprocesamiento. La corrección de línea base ofrece cuatro métodos (mínimos cuadrados asimétricos, polinomial, SNIP y banda elástica (rubberband)). Incluye suavizado Savitzky-Golay, tres modos de normalización (mín-máx, vectorial y pico máximo), primera y segunda derivada, eliminación de picos espurios (spikes) y corrección ATR para cristales de diamante, germanio, ZnSe y silicio. Los controles responden de inmediato al mover los deslizadores.

Ajuste de curvas y PCA. El ajuste de curvas admite perfiles de pico gaussianos, lorentzianos y pseudo-Voigt. El análisis de componentes principales (PCA) agrupa un conjunto de espectros según sus principales fuentes de variación, lo que resulta útil para clasificar muestras o detectar valores atípicos. En estas dos funciones SpectralBench supera a otras herramientas web gratuitas; Open Specy y Essential FTIR no ofrecen ninguna de las dos.

Comparación y operaciones matemáticas con espectros. Puede superponer o apilar varios espectros, y restarlos, promediarlos o calcular su cociente.

Interpretación con IA. Un intérprete de IA sugiere grupos funcionales y posibles compuestos para un espectro cargado. Funciona con modelos de lenguaje de uso general de Google y OpenAI, no con un modelo entrenado solo con espectros, así que tome sus resultados como punto de partida y confirme las asignaciones con datos de referencia.

Exportación. Los datos procesados se exportan como archivos CSV, JCAMP-DX, SPC o MATLAB, y el convertidor de archivos puede convertir un lote de archivos y descargarlos en un solo ZIP. Las figuras se exportan en PNG, SVG, PDF o TIFF, con tamaños predefinidos para las revistas de ACS, Nature, RSC, Wiley y Elsevier. Por ahora todo esto es gratuito; según los precios previstos de SpectralBench, la exportación TIFF y los formatos predefinidos de RSC, Wiley y Elsevier pasarán a los planes de pago, y el PCA gratuito se limitará a 5 espectros y el ajuste de curvas a 3 picos.

Biblioteca de referencia

La biblioteca contiene más de 50,000 espectros de referencia procedentes de fuentes de acceso abierto, que abarcan minerales, polímeros, compuestos orgánicos, suelos y otras categorías en FTIR, Raman, NIR, UV-Vis, fluorescencia y espectrometría de masas. Puede buscar por nombre del compuesto, fórmula o número CAS, o comparar un espectro cargado con la biblioteca. SpectralBench también publica en Zenodo un subconjunto curado de la biblioteca con un DOI, de modo que un conjunto de datos usado en un artículo se puede citar.

La biblioteca es grande para una herramienta gratuita, pero pequeña frente a las bibliotecas comerciales que se venden con OPUS y OMNIC, que llegan a cientos de miles de espectros. Sin iniciar sesión, los espectros de referencia se muestran con resolución reducida (250 puntos); para ver datos de referencia con resolución completa en las superposiciones de coincidencias se necesita una cuenta.

En qué se queda corto

• Sin modo sin conexión. Los archivos se suben a los servidores de SpectralBench y se leen allí. Eso lo descarta para el trabajo de campo sin conexión, las computadoras de laboratorio aisladas de la red y las muestras confidenciales que no pueden salir del edificio.
• Límites de tamaño de archivo. 4 MB sin cuenta y 100 MB con una cuenta gratuita. Las herramientas de escritorio no tienen ese límite.
• Sin RMN ni XRD. Quienes trabajan con RMN necesitan MestReNova o una herramienta similar.
• No apto para laboratorios regulados. El aviso legal de SpectralBench excluye las presentaciones regulatorias, las pruebas GLP/GMP y el trabajo que requiere validación conforme a 21 CFR Part 11.
• Entorno de trabajo solo en inglés. La página de inicio está disponible en 9 idiomas, pero el entorno de trabajo y la mayoría de las demás páginas están en inglés.
• Poca trayectoria. SpectralBench es nuevo y tiene pocas citas en investigaciones publicadas, algo que importa a los revisores que esperan software consolidado en la sección de métodos.

Ventajas y desventajas

Cómo se compara SpectralBench

Las puntuaciones son las mismas que usamos en todo SpectraComp, de mayor a menor.

Frente a Spectragryph, SpectralBench sacrifica la velocidad sin conexión y el soporte de RMN/XRD a cambio de desarrollo activo, PCA y ninguna instalación. Nuestra guía de alternativas a Spectragryph compara ambos función por función. Frente a OPUS y OMNIC, carece de control de instrumentos, flujos de trabajo validados y grandes bibliotecas comerciales, pero no cuesta nada y lee los archivos de ambos fabricantes. La matriz comparativa de software de espectroscopía permite filtrar todas estas herramientas por técnica, plataforma y precio.

Para quién es

• Adecuado para: laboratorios académicos y estudiantes sin presupuesto para software, instalaciones con varios instrumentos que necesitan abrir archivos de distintos fabricantes, y cualquier persona con macOS, Linux o Chromebook que no pueda usar herramientas exclusivas de Windows.
• Poco adecuado para: laboratorios GMP/GLP y otros laboratorios regulados, sitios sin una conexión a internet confiable, laboratorios cuyos datos no pueden salir de su red y grupos de RMN.

Preguntas frecuentes